بخش زنان واقع در طبقه دوم پژوهشکده علوم تولید مثل یزد می باشد. این واحد درمانی مجهز به ۳ اتاق عمومی ۱و۲و۳، یک اتاق خصوصی(IPD) ویک اتاق تزریقات می باشد. که در مجموع۲۸ تخت فعال را شامل می شود. در این بخش درمانی بیماران کاندید پونکسیون تخمدان(تخمک کشی)، ترانسفر(انتقال جنین)، لاپاراسکوپی، هیستروسکوپی، پونکسیون کیست و IUI به صورت روزانه بستری می گردند وبعد از انجام آمادگی های قبل از عمل توسط پرسنل بخش به اتاق عمل منتقل می شوند وپس ازپایان عمل به بخش منتقل می شوند. هر کدام از بیماران با توجه به تشخیص پزشک معالج عصر روز عمل یا صبح بعد از عمل ترخیص می شوند. بیمارانی که به سندرم تحریک بیش از حد تخمدان  OHSS مبتلا شوند نیز در این بخش تحت نظر قرار می گیرند وبسته به نظر پزشک معالج چند روز بستری هستند.